Engelska

Vid tillräcklig efterfrågan

Kursens syfte är att ge doktoranden avancerad kunskap om NMR-teori och tillämpningar för studier av biomakromolekylär struktur och dynamik. Kursen fokuserar på metoder för att studera proteiner, men den grundläggande teorin är lika tillämplig på i stort sett alla slags molekyler i lösning.

Kursen börjar med grundläggande NMR-teori, inklusive en introduktion till kvantmekanik, kvant-statistisk mekanik, täthetsoperator- och produktoperator-formalismen. Kurser omfattar vidare teori för mångdimensionell spektroskopi, inklusive frekvensmärkning av koherenser, koherensöverföring och s.k. mixing, samt koherensselektion. Kursen omfattar även experimentella tekniker and praktiska aspekter, inklusive datainsamling and data processning.

förstå och kunna förklara de grundläggande principerna för multidimensionell spektroskopi
ha kunskap om hur man använder täthetsmatris- och produktoperator-formalismen för att tolka en multidimensionell NMR-pulssekvens.
ha kunskap om metoder för koherensselektion.
ha kunskap om hur man processar NMR-data för multidimensionella spektra.
ha kunskap om NMR-experiment som används för atomspecifik resonanstillordning och strukturbestämning.

kunna tolka multi-dimensionella NMR pulssekvenser utifrån en beskrivning med täthetsmatris- och produktoperatorformalism.
kunna designa nya pulssekvenser för att insamla en given sorts NMR-data.
kunna göra välgrundade beslut om lämpliga kombinationer av NMR-experiment för atomspecifik resonanstillordning av proteiner (eller andra makromolekyler) av ett givet slag (storlek, spektralupplösning, etc)
kunna processa multi-dimensionella NMR-data
kunna presentera resultat and tolkningar av NMR-experiment, både skriftligt och muntligt.

kunna kritiskt utvärdera resultatet av ett NMR-experiment i termer av precision och noggrannhet, tillförlitlighet, och tillämpbarhet.
kunna kritiskt utvärdera forskningslitteratur som beskriver NMR-tillämpningar.
ha förmågan att välja den NMR-teknik som är mest lämplig för en given forskningsfrågeställning.
ha en bred insikt om tillämpningar utanför sitt eget huvudsakliga forskningsområde.
ha förmågan att delta aktivt i kvalificerade diskussioner om tillämpningar och tolkningar av NMR-experiment.

Seminarier

Projekt

Litteraturkurs som självstudier

Kursen är organiserad kring seminarier och diskussionsträffar där grupper av doktorander presenterar tilldelat inläsningmaterial.
Kursen inkluderar dessutom ett projekt där varje doktorand får i uppgift att analysera en pulssekvens beskriven i forskningslitteraturen.

Skriftlig rapport

Inlämningsuppgifter

Doktoranderna löser inlämningsuppgifter under kursen.

Som avslutning på kursen får varje doktorand sig tilldelad en forskningsartikel som ska analyseras i detalj med hjälp av den teori som presenterats i kursen och sedan presenteras i en skriftlig rapport.

Underkänd, godkänd

KFKN01, Magnetresonans — Spektroskopi och avbildning, eller en jämförbar kurs.

Matematik motsvarande kursomfånget på K- eller B-programmen på LTH:

J, C., WJ, F., AG, P., M, R. & NJ, S.: Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice, 2nd Edition. Elsevier Academic Press, 2007. ISBN 9780121644918.

Kursboken kommer att komplementeras med översiktsartiklar som delas ut under kursen.

Kursen erbjudes när ett tillräckligt antal doktorander har uttryckt intresse. Normalt innebär detta minst 3-4 doktorander för att uppnå en välfungerande kamratundervisning.

KFK001F

2020-03-19

Margareta Sandahl