Engelska

Varje hösttermin

Kursen syftar till att ge studenten:
- en molekylär förståelse av proteiners struktur, stabilitet, växelverkan och dynamik.
- kunskaper om de viktigaste fysikaliska metoderna som används inom modern proteinvetenskap.
- praktisk erfarenhet av några av dessa metoder.
den kunskapsbas som behövs för att ta del av och kritiskt bedöma forskningslitteraturen inom proteinvetenskap.

Kursen behandlar följande huvudmoment:
- Proteiners kemiska uppbyggnad och tredimensionella strukturer: Strukturbestämning med röntgenkristallografi; Struktur- och sekvensdatabaser; Bioinformatik.
- Karaktärisering av proteiner med optisk spektroskopi: Fysikaliska principer för och tillämpningar av fluorescens och cirkulärdikroism spektroskopi.
- Polypeptiders konformation: Modeller för polymerkonformation och konformationsomvandlingar; Konformationsentropi; Veckningskooperativitet.
- Proteiners energetik och stabilitet: Packning; Hydratisering; Elektrostatik; Termisk och lösningsmedelsinducered denaturering; Differentiell scanning kalorimetri.
- Proteindynamik: Kinetiska modeller; Protonutbyte; Diffusionskontroll; Proteinveckning; Datorsimulering av proteiner.
- Kärnmagnetisk resonans: Principer för NMR spektroskopi och relaxation; Bestämning av struktur, växelverkan och dynamik för proteiner i lösning.
- Associationsprocesser: Ligandbindning; Allosteri; Proteinaggregering; Isoterm titrerkalorimetri; Ytplasmonresonans.

beskriva proteiners viktigaste fysikalisk-kemiska egenskaper, såsom struktur, stabilitet, växelverkan och dynamik
förklara dessa egenskaper med hjälp av teoretiska modeller på molekylär nivå
tolka experimentella resultat från fysikalisk-kemiska undersökningar av proteiner

använda fysikalisk-kemiska begrepp och modeller för lösa problem som rör proteiner
tillämpa sina teoretiska kunskaper på biotekniska och biomedicinska problemställningar
utnyttja elektroniska proteindatabaser
utföra spektroskopiska mätningar på proteiner

ta del av och kritiskt bedöma den vetenskapliga litteraturen inom proteinvetenskap
kommunicera effektivt med forskare inom proteinvetenskap

Föreläsningar

Seminarier

Laborationer

Projekt

Studiebesök

Skriftlig tentamen

Seminarieföredrag av deltagarna

Underkänd, godkänd

Motsvarande KFKA05 Molekylära drivkrafter 1: Termodynamik samt KFKF01 Molekylära drivkrafter 2: Växelverkan och dynamik.

 

Kurslitteraturen utgörs av kompendiet "Biophysical Chemistry", författat och årligen uppdaterat av lärarna på kursen, samt av laborationshandledningar. För den som vill gå djupare finns i kompendiet ett urval referenser och länkar till litteraturen.

KFKN10F

 -05-15

Margareta Sandahl