Gäller från och med: Höstterminen 2017
Beslutad av: Margareta Sandahl
Datum för fastställande: 2017-05-15
Avdelning: Biofysikalisk kemi
Kurstyp: Gemensam kurs, avancerad nivå och forskarnivå
Kursen ges även på avancerad nivå med kurskod: KFKN10
Undervisningsspråk: Engelska
Kursen syftar till att ge studenten: - en molekylär förståelse av proteiners struktur, stabilitet, växelverkan och dynamik. - kunskaper om de viktigaste fysikaliska metoderna som används inom modern proteinvetenskap. - praktisk erfarenhet av några av dessa metoder. den kunskapsbas som behövs för att ta del av och kritiskt bedöma forskningslitteraturen inom proteinvetenskap.
Kunskap och förståelse
För godkänd kurs skall doktoranden
Färdighet och förmåga
För godkänd kurs skall doktoranden
Värderingsförmåga och förhållningssätt
För godkänd kurs skall doktoranden
Kursen behandlar följande huvudmoment: - Proteiners kemiska uppbyggnad och tredimensionella strukturer: Strukturbestämning med röntgenkristallografi; Struktur- och sekvensdatabaser; Bioinformatik. - Karaktärisering av proteiner med optisk spektroskopi: Fysikaliska principer för och tillämpningar av fluorescens och cirkulärdikroism spektroskopi. - Polypeptiders konformation: Modeller för polymerkonformation och konformationsomvandlingar; Konformationsentropi; Veckningskooperativitet. - Proteiners energetik och stabilitet: Packning; Hydratisering; Elektrostatik; Termisk och lösningsmedelsinducered denaturering; Differentiell scanning kalorimetri. - Proteindynamik: Kinetiska modeller; Protonutbyte; Diffusionskontroll; Proteinveckning; Datorsimulering av proteiner. - Kärnmagnetisk resonans: Principer för NMR spektroskopi och relaxation; Bestämning av struktur, växelverkan och dynamik för proteiner i lösning. - Associationsprocesser: Ligandbindning; Allosteri; Proteinaggregering; Isoterm titrerkalorimetri; Ytplasmonresonans.
Kurslitteraturen utgörs av kompendiet "Biophysical Chemistry", författat och årligen uppdaterat av lärarna på kursen, samt av laborationshandledningar. För den som vill gå djupare finns i kompendiet ett urval referenser och länkar till litteraturen.
Undervisningsformer: Föreläsningar, seminarier, laborationer, projekt, studiebesök
Examinationsformer: Skriftlig tentamen, seminarieföredrag av deltagarna
Betygsskala: Underkänd, godkänd
Examinator: Biträdande universitetslektor Kristine Steen Jensen
Förutsatta förkunskaper: Motsvarande KFKA05 Molekylära drivkrafter 1: Termodynamik samt KFKF01 Molekylära drivkrafter 2: Växelverkan och dynamik.
Startdatum: 2024-11-04
Slutdatum: 2025-01-13
Kursfart: Halvfart
Vänligen skicka ett e-postmeddelande till kursansvarig.
Kursansvariga: