Kursen omfattar föreläsningar och workshops med följande teman: metabola reaktionsvägar, stammodifiering, ämnesbalans, metabol kontrollanalys, metabol flödesanalys och systembiologi. Övningarna består av beräkning av kolbalanser, redoxbalanser, flödesanalyser och metabol kontrollanalys. Kursen inkluderar också en litteraturstudie som omfattar en grundlig undersökning av olika forskningsstrategier applicerade på en specifik frågeställning inom metabolic engineering.